Culture polymicrobienne : que signifie le résultat ?
Une culture polymicrobienne indique que plusieurs micro-organismes ont poussé dans un prélèvement. Ce résultat ne suffit pas, à lui seul, à conclure à une infection.
Selon le site prélevé et les conditions de recueil, il peut correspondre à une flore naturellement présente, à une contamination du prélèvement ou à une infection impliquant plusieurs germes. Le compte rendu doit donc être interprété avec les symptômes et le contexte médical.
Comment une culture microbiologique est-elle réalisée ?
Une culture microbiologique commence par un prélèvement réalisé sur un site donné. Sa qualité dépend notamment de la manière dont il est recueilli, puis transporté jusqu’au laboratoire. Pour certaines cultures, le transport et les conditions de conservation peuvent influencer le résultat.
Au laboratoire, le prélèvement est placé dans des conditions permettant une éventuelle croissance des micro-organismes. Les germes qui se développent peuvent ensuite être identifiés. Un antibiogramme peut également être réalisé : cet examen étudie la sensibilité des micro-organismes identifiés à certains antibiotiques. Il n’est toutefois pas systématiquement possible d’identifier, par la culture, la cause d’un problème à partir du seul résultat.
Pour mieux comprendre la place de ces examens, le catalogue des analyses de laboratoire présente les examens microbiologiques proposés et expliqués par Airbio.
Pourquoi plusieurs germes peuvent-ils pousser ?
La présence de plusieurs micro-organismes peut avoir plusieurs significations. Certains sites de l’organisme abritent habituellement une flore composée de différents germes. Leur croissance dans une culture peut alors refléter cette flore attendue, sans démontrer une infection.
Une autre possibilité est la contamination du prélèvement. Elle peut survenir lors du recueil, de la manipulation ou du transport. Le site prélevé, la qualité du recueil et les conditions de conservation sont donc déterminants pour comprendre la portée du résultat.
Enfin, plusieurs germes peuvent parfois participer à une même infection. La mention « polymicrobienne » décrit alors la croissance observée, mais ne permet pas de retenir cette interprétation sans la confronter aux symptômes, au site concerné et aux autres éléments du compte rendu.
Comment lire le compte rendu de culture ?
La lecture commence par l’identification du type de prélèvement et du site concerné. Un même résultat n’a pas la même signification selon l’endroit où l’échantillon a été recueilli. Il faut ensuite regarder les micro-organismes mentionnés, leur nombre et, lorsque le laboratoire le précise, la prédominance éventuelle de l’un d’entre eux.
Le compte rendu peut aussi comporter :
- une quantification éventuelle de la croissance, sans appliquer automatiquement un seuil à toutes les situations ;
- la mention de leucocytes, c’est-à-dire de cellules impliquées dans la réponse inflammatoire ;
- un commentaire du laboratoire sur la qualité ou l’interprétation du prélèvement ;
- un antibiogramme, lorsqu’il a été réalisé.
Aucun de ces éléments ne doit être isolé du reste du document. L’interprétation repose sur l’ensemble du compte rendu et sur les symptômes connus du prescripteur. Une valeur ou une mention individuelle doit être expliquée par un professionnel qui dispose du contexte complet.
Faut-il refaire le prélèvement ou traiter ?
La décision de refaire un prélèvement dépend notamment de sa qualité, du site concerné, des conditions de recueil et des symptômes. Un résultat comportant plusieurs germes ne conduit donc pas automatiquement à répéter l’examen.
De la même façon, la présence de plusieurs micro-organismes ne justifie pas à elle seule un antibiotique. Le prescripteur confronte le compte rendu à la situation clinique et peut tenir compte de l’identification des germes, de leur prédominance éventuelle et de l’antibiogramme lorsqu’il est disponible.
Il est utile de transmettre au professionnel de santé le compte rendu complet, le type de prélèvement réalisé et les informations sur les conditions de recueil qui pourraient être connues.
Une culture polymicrobienne exige une lecture contextualisée
Une culture polymicrobienne signifie que plusieurs micro-organismes ont été mis en évidence dans le prélèvement, mais elle ne permet pas de distinguer seule une flore attendue, une contamination ou une infection. Le site prélevé, la qualité du recueil, les germes identifiés, leur éventuelle prédominance et les symptômes orientent la lecture. Le résultat doit être discuté avec le prescripteur, sans commencer ni modifier un traitement sur cette seule base.